La rectora es la máxima autoridad ejecutiva y la representante legal de la universidad, presidenta del Consejo General Universitario. Su cargo dura seis años. Su principal actividad es la de dirigir el rumbo de la institución en el ámbito académico, administrativo y financiero.

Dra. Norma Liliana Galván Meza. Rectora para el periodo 2022-2028